1926 yılında Malatya’da doğdu. İlk, orta ve lise öğrenimini bu ilde tamamladı. 1955 yılında Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi Felsefe ve Sosyoloji Bölümü’nden mezun oldu. 1955-59 yılları arasında Malatya Lisesi Felsefe öğretmenliğinde bulundu. 1959 yılında Atatürk Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Sosyoloji asistanlığına atandı. 1962 yılında Doktor, 1967 yılında Doçent ve 1971 yılında da Profesörlük unvanını aldı.
1971 yılında, Almanya’nın davetlisi olarak, Hohenheim Üniversitesi’nde birinci kuşak Türk işçileri üzerinde araştırmalarını yürüttü. Yine,1980’de Alman devletinin isteği üzerine, aynı üniversitede, ikinci kuşak Türk işçilerinin toplumsal uyumsuzluk ve kültürel entegrasyon gibi temel sorunlarını incelmemiştir.
Türkdoğan, 1959 yılından itibaren ülkemizde yaşayan Rus kökenli Molakanlar, Estonlar, Kozaklar, Polonezler, Süryaniler gibi dış etnik gruplar yanında, yerel Kürt ve Zaza halkları üzerindeki saha araştırmalarını da sürdürmüş ve ilk kez ülkemizde yaşayan tüm yerli-yabancı etnik grupların sosyal varlık alanlarını 1995 yılında Etnik Sosyoloji adı altında yayımlamıştır. Ayrıca, 17 il ve 45 ocakta yaşayan Alevi-Bektaşi grupları ile Doğu-Güneydoğu yörelerinde egemen olan 21 kadar kabile ve aşiret kuruluşlarını da yine aralarında yaşayarak, 1995 ve 1997 yıllarında yayımlamıştır.
Prof. Dr. Türkdoğan, 2008 yılında Türkiye Büyük Millet Meclisi onur ödülüne layık görülmüştür. 1995-2010 yılları arasında Timaş Yayınevi 11, İ.Q.Yayınevi 19, Milli Eğitim Bakanlığı da 2 adet kitabını yayımlamıştır.